Do zawieszenia postępowania przez organ podatkowy dochodzi w przypadku śmierci strony bądź jednej z uczestniczących w postępowaniu stron. W sytuacji, gdy śmierć strony czyni postępowanie bezpodmiotowym, organ podatkowy powinien podjąć decyzję o jego umorzeniu. Postępowanie ulega zawieszeniu także wtedy, gdy strona lub jej przedstawiciel ustawowy utraci zdolność do czynności prawnych.
Innym przypadkiem, gdy postepowanie podatkowe zostaje zawieszone jest sytacja, gdy wydanie decyzji w postępowaniu uzależnione jest od rozpatrzenia zagadnienia wstępnego przez inny organ lub sąd. Postępowanie ulega także zawieszeniu, gdy organ je przeprowadzający wystąpi do organów innego państwa o udzielenie informacji koniecznych przy ustalaniu wysokości zobowiązania podatkowego strony postępowania.