Zgodnie z nowym rozporządzeniem prezydenta, sprawami dotyczącymi skarg na indywidualne interpretacje podatkowe wydawane przez resort finansów, znowu zajmować będą się wszystkie wojewódzkie sądy administracyjne. Dotychczas uprawniony był do tego jedynie Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie.

Zniknie zatem trudność, jaką stwarzały zapisy poprzedniej Ordynacji podatkowej, nakazujące kierowanie wniosków do sądu administracyjnego właściwego dla siedziby organu wydającego interpretację (Ministerstwa Finansów), a więc placówki warszawskiej. Konieczne było wówczas kierowanie skarg, nie do organów lokalnych właściwych dla swojego miejsca zamieszkania, a do zazwyczaj oddalonego sądu w stolicy.

Wraz ze zmianą tych regulacji wraca więc droga rozstrzygania skarg na interpretacje podatkowe sprzed zastosowania poprzednich rozwiązań . Skargi kierować trzeba będzie więc już tylko do wojewódzkiego sądu administracyjnego z siedzibą w najbliższym dla nas regionie. Można również przenieść do organów lokalnych te zaskarżone interpretacje, które zostały złożone do warszawskiego sądu przed zmianą przepisów, a nadal czekają na rozstrzygnięcie. Datą publikacji rozporządzenia w Dzienniku Ustaw (nr 163 pod poz. 1016) 28 sierpnia 2008 r. Wejdzie więc ono w życie 11 października.