Komisja Europejska jest niezadowolona z procesu zmian polskich przepisów VAT. Członkowie KE twierdzą, że niektóre polskie regulacje wciąż nie są zgodne z prawem UE. Chodzi głównie o opodatkowanie usług transportowych.

Jeśli Polska nie dostosuje przepisów VAT do unijnych regulacji, sprawa może trafić do Trybunału Sprawiedliwości. Komisja zarzuciła nam naruszenie przepisów UE przez wprowadzenie szczególnego systemu VAT. Chodzi o opodatkowanie usług transgranicznego transportu pasażerskiego, wykonywanych sporadycznie autobusami zarejestrowanymi za granicą.

Od kierowców autobusu wymaga się zapłaty podatku w urzędzie celnym z chwilą wjazdu autobusu na terytorium Polski - to pierwsza zasada, która nie podoba się Komisji Europejskiej. Członkowie Komisji nie zgadzają się również na ustalanie kwoty podatku od każdego pasażera, jako iloczyn stawki 7 proc. i kwoty 285 zł. Zdaniem KE, niedopuszczalny jest też fakt, że firmy nie mogą odzyskać VAT zapłaconego w Polsce.