Pomimo, że urzędy skarbowe nie przyznają przedsiębiorcom zwrotu VAT, to coraz częściej sądy administracyjne wydają korzystne wyroki dla podatników.

"Rzeczpospolita" piszę, że "przepis, w myśl którego obniżenia kwoty lub zwrotu różnicy podatku nie stosuje się do podatników, którzy nie są zarejestrowani jako podatnicy VAT czynni, od dawna jest kością niezgody między organami podatkowymi a przedsiębiorcami kończącymi działalność (art. 88 ust. 4 ustawy o VAT). Urzędnicy sukcesywnie odmawiają przedsiębiorcom zwrotu podatku. Ci natomiast, by uniknąć sporu, wstrzymują się ze zgłoszeniem zaprzestania prowadzenia firmy.

Zwrot różnicy podatku następuje na rachunek bankowy podatnika w banku mającym siedzibę na terytorium kraju wskazanym w zgłoszeniu identyfikacyjnym NIP. Tyle mówią przepisy. Opierając się na ich literalnym brzmieniu, organy podatkowe twierdzą, że zwrot może otrzymać wyłącznie podatnik, który w momencie jego dokonywania jest zarejestrowany jako podatnik VAT. Sam zwrot może nastąpić wyłącznie na rachunek bankowy utrzymywany w związku z prowadzoną przez niego działalnością, wskazany w zgłoszeniu identyfikacyjnym. Zdaniem fiskusa zarówno wykreślenie z rejestru podatników VAT, jak i likwidacja rachunku bankowego przed upływem terminu, jaki zgodnie z przepisami urząd skarbowy ma na dokonanie zwrotu, praktycznie wyklucza jego otrzymanie."