Na wysokość w podatku dochodowym wpływa korekta, jaką dokona podatnik przy obrocie spółki o należny VAT.

"Gazeta Prawna” podała konkretny przykład. Otóż, spółka zwróciła się do urzędu, który wydał w tej sprawie "trzy decyzje w zakresie podatku od towarów i usług, w których zakwestionował zastosowanie stawki 0 proc. i nakazał zastosowanie stawki podstawowej, co miało wpływ na obroty firmy. W związku z tym spółka pytała, czy w sytuacji, gdy urząd pomniejszył jej obrót, podatek należny VAT zmniejsza jej podstawę opodatkowania. Zdaniem naczelnika urzędu skarbowego, spółka miała prawo do skorygowania przychodu o podatek należny.”

Czytamy dalej w "Gazecie Prawnej”, że "z takim stanowiskiem nie zgodził się dyrektor izby skarbowej, który z urzędu zmienił decyzję naczelnika urzędu. Powołał się na przepis art. 12 ust. 4 pkt 9 ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych (t.j. Dz.U. z 2000 r. nr 54, poz. 654 z późn. zm.), zgodnie z którym do przychodów nie zalicza się należnego podatku od towarów i usług. Zdaniem dyrektora izby podatnik nie mógł więc pomniejszyć przychodów o należny VAT. Ponadto przychód dotyczący podatku od towarów i usług nie może być taki sam jak przychód dla celów podatku dochodowego od osób prawnych. Mimo zażalenia firmy dyrektor nie zmienił swojej decyzji. Dodał, że VAT należny jest poza kategorią przychodów i kosztów w rozumieniu ustawy o CIT. A skoro jest wyłączony z przychodu, to podstawą opodatkowania jest kwota netto. Spółka odwołała się więc do sądu. Nie zgodziła się bowiem, że w wyniku decyzji organu zmniejszającej obrót nie może pomniejszyć przychodu o VAT. Pełnomocnik organów twierdziła natomiast, że przyjęcie stanowiska, zgodnie z którym zmiana wysokości podatku od towarów i usług może mieć wpływ na podatek dochodowy, oznaczałoby, że VAT może być kosztem uzyskania przychodu. Takie stanowisko jest więc nieprawidłowe.”